Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Syndig1A2ANU3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms