Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Lcn6A2AJB9 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms