Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc163A2AGD7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms