Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Prdm16A2A935 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Prdm16A2A935 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Prdm16A2A935 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Prdm16A2A935 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Prdm16A2A935 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Prdm16A2A935 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Prdm16A2A935 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm16A2A935 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms