Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ilf3Q9Z1X4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms