Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NgfrQ9Z0W1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NgfrQ9Z0W1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms