Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Xpr1Q9Z0U0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Xpr1Q9Z0U0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Xpr1Q9Z0U0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xpr1Q9Z0U0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xpr1Q9Z0U0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xpr1Q9Z0U0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xpr1Q9Z0U0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xpr1Q9Z0U0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xpr1Q9Z0U0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xpr1Q9Z0U0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Xpr1Q9Z0U0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xpr1Q9Z0U0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xpr1Q9Z0U0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xpr1Q9Z0U0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xpr1Q9Z0U0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xpr1Q9Z0U0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xpr1Q9Z0U0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Xpr1Q9Z0U0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms