Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bgrQ9WUZ7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bgrQ9WUZ7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bgrQ9WUZ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms