Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU62

Incenp, Inner centromere protein, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IncenpQ9WU62 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IncenpQ9WU62 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IncenpQ9WU62 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IncenpQ9WU62 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IncenpQ9WU62 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
IncenpQ9WU62 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IncenpQ9WU62 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IncenpQ9WU62 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IncenpQ9WU62 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IncenpQ9WU62 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IncenpQ9WU62 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IncenpQ9WU62 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms