Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Usp18Q9WTV6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Usp18Q9WTV6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Usp18Q9WTV6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Usp18Q9WTV6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Usp18Q9WTV6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Usp18Q9WTV6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp18Q9WTV6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
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Usp18Q9WTV6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Usp18Q9WTV6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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Usp18Q9WTV6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Usp18Q9WTV6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Usp18Q9WTV6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Usp18Q9WTV6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Usp18Q9WTV6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Usp18Q9WTV6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Usp18Q9WTV6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp18Q9WTV6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms