Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrpxQ9R0M3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SrpxQ9R0M3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms