Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NrkQ9R0G8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NrkQ9R0G8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NrkQ9R0G8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NrkQ9R0G8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms