Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr54Q9R0D8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr54Q9R0D8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms