Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col4a3Q9QZS0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a3Q9QZS0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a3Q9QZS0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms