Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nphp1Q9QY53 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphp1Q9QY53 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphp1Q9QY53 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms