Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nr2e3Q9QXZ7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms