Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ndufaf3Q9JKL4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf3Q9JKL4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms