Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mrpl39Q9JKF7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms