Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msgn1Q9JK54 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Msgn1Q9JK54 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms