Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrip3Q9JJR9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip3Q9JJR9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms