Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp29Q9ES63 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp29Q9ES63 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp29Q9ES63 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms