Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn12Q9ER56 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn12Q9ER56 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms