Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Chst1Q9EQC0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Chst1Q9EQC0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.3 ms