Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Scp2d1Q9DAH1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scp2d1Q9DAH1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms