Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm5Q9D806 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms