Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tspan17Q9D7W4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms