Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6K8

Fundc2, FUN14 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc2Q9D6K8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fundc2Q9D6K8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fundc2Q9D6K8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fundc2Q9D6K8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fundc2Q9D6K8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fundc2Q9D6K8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fundc2Q9D6K8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fundc2Q9D6K8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fundc2Q9D6K8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fundc2Q9D6K8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fundc2Q9D6K8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fundc2Q9D6K8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fundc2Q9D6K8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms