Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Zbed3Q9D0L1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zbed3Q9D0L1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zbed3Q9D0L1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zbed3Q9D0L1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
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