Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gtf2e1Q9D0D5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gtf2e1Q9D0D5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gtf2e1Q9D0D5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms