Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nicn1Q9CQM0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nicn1Q9CQM0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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