Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SrrtQ99MR6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SrrtQ99MR6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SrrtQ99MR6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms