Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnpo2Q99LG2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnpo2Q99LG2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnpo2Q99LG2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms