Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RtcbQ99LF4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RtcbQ99LF4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RtcbQ99LF4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RtcbQ99LF4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms