Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf112Q96DY5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf112Q96DY5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms