Protein–RNA interactions for Protein: Q922R1

UPF0183 protein C16orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q922R1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q922R1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q922R1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q922R1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q922R1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q922R1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q922R1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q922R1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q922R1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q922R1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q922R1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q922R1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q922R1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q922R1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q922R1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q922R1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q922R1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q922R1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q922R1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q922R1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q922R1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q922R1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q922R1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q922R1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q922R1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q922R1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q922R1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q922R1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q922R1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q922R1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q922R1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q922R1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q922R1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q922R1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q922R1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q922R1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q922R1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q922R1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q922R1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q922R1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q922R1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q922R1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q922R1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q922R1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q922R1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q922R1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q922R1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q922R1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q922R1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q922R1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q922R1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q922R1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q922R1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q922R1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q922R1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q922R1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q922R1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q922R1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q922R1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q922R1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q922R1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q922R1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q922R1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q922R1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q922R1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q922R1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q922R1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q922R1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q922R1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q922R1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q922R1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q922R1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q922R1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q922R1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q922R1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q922R1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q922R1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q922R1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q922R1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q922R1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q922R1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q922R1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q922R1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q922R1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q922R1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q922R1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q922R1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q922R1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q922R1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q922R1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q922R1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q922R1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q922R1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q922R1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q922R1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q922R1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q922R1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q922R1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q922R1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q922R1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms