Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q9

Chid1, Chitinase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chid1Q922Q9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chid1Q922Q9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Chid1Q922Q9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chid1Q922Q9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Chid1Q922Q9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chid1Q922Q9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chid1Q922Q9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chid1Q922Q9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chid1Q922Q9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Chid1Q922Q9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chid1Q922Q9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chid1Q922Q9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chid1Q922Q9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chid1Q922Q9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chid1Q922Q9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Chid1Q922Q9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chid1Q922Q9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chid1Q922Q9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chid1Q922Q9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chid1Q922Q9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms