Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Traf7Q922B6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Traf7Q922B6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf7Q922B6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms