Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf3Q920N1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Odf3Q920N1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Odf3Q920N1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms