Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc71Q8VEG0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc71Q8VEG0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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