Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc115Q8VE99 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc115Q8VE99 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc115Q8VE99 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms