Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc18Q8VD24 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc18Q8VD24 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zcchc18Q8VD24 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zcchc18Q8VD24 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zcchc18Q8VD24 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zcchc18Q8VD24 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zcchc18Q8VD24 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zcchc18Q8VD24 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zcchc18Q8VD24 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc18Q8VD24 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc18Q8VD24 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc18Q8VD24 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc18Q8VD24 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc18Q8VD24 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc18Q8VD24 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc18Q8VD24 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zcchc18Q8VD24 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zcchc18Q8VD24 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms