Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nup35Q8R4R6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nup35Q8R4R6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms