Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pof1bQ8K4L4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pof1bQ8K4L4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pof1bQ8K4L4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms