Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prpf39Q8K2Z2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prpf39Q8K2Z2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms