Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2D3

Edc3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc3Q8K2D3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Edc3Q8K2D3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Edc3Q8K2D3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Edc3Q8K2D3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms