Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prkd3Q8K1Y2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prkd3Q8K1Y2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkd3Q8K1Y2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkd3Q8K1Y2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkd3Q8K1Y2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkd3Q8K1Y2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkd3Q8K1Y2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkd3Q8K1Y2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkd3Q8K1Y2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkd3Q8K1Y2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkd3Q8K1Y2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkd3Q8K1Y2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prkd3Q8K1Y2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prkd3Q8K1Y2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prkd3Q8K1Y2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prkd3Q8K1Y2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prkd3Q8K1Y2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prkd3Q8K1Y2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms