Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TwnkQ8CIW5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TwnkQ8CIW5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms