Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp44Q8C2S0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp44Q8C2S0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp44Q8C2S0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp44Q8C2S0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp44Q8C2S0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp44Q8C2S0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp44Q8C2S0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp44Q8C2S0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp44Q8C2S0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp44Q8C2S0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp44Q8C2S0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp44Q8C2S0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp44Q8C2S0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp44Q8C2S0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp44Q8C2S0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp44Q8C2S0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms