Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
U2af1l4Q8BGJ9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
U2af1l4Q8BGJ9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2af1l4Q8BGJ9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms