Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lrrtm2Q8BGA3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrtm2Q8BGA3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms